以分居为由提起离婚诉讼的方式是：夫妻一方首先向递交起诉状，并按照被告人数提出副本；然后，受理后，应当先进行调解；调解无效的的，进行审理；确定夫妻是因感情不和分居满二年的，应当判决准予离婚。
【法律依据】
《民法典》第一千零七十九条第一款、第二款
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。
人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十条
起诉应当向人民递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民记入笔录，并告知对方当事人。
